Мучительная болезнь нефрит (воспаление почек), нередко приводящая к смерти, вызывается бактериальной инфекцией почечных клеток. Бактерии обычно инфицируют почечные клубочки, которые становятся при этом более проницаемыми, так что белки и даже целые кровяные клетки проходят в мочу. Вследствие непрерывной потери белков крови способность плазмы всасывать воду из тканевой жидкости, окружающей капилляры, уменьшается и возникает водянистое набухание тканей, так называемый отек, особенно выраженный в нижних частях ног. В последних стадиях нефрита количество образующейся мочи резко снижается и продукты обмена, в нормальных условиях выделяемые почками, накапливаются в крови (состояние, называемое уремией). Поскольку некоторые из этих веществ токсичны, смерть может быть предотвращена только быстрым выведением больного из состояния уремии. 

Поражение почек часто сочетается с повышенным кровяным давлением, так как высокое давление легко повреждает почечные клубочки, а уменьшение притока крови к клеткам почек вследствие сужения артерий тоже может причинить вред. Поврежденные почки выделяют в кровь вещество, называемое ренином, которое вызывает сужение кровеносных сосудов и тем самым повышает кровяное давление; таким образом, порочный круг замыкается. 

Некоторые из твердых веществ, нормально присутствующие в моче (мочевая кислота и фосфат кальция), плохо растворимы, и если количество их в моче повышено, они могут выпадать в мочевых путях в осадок, образуя почечные камни. Если камни становятся настолько крупными, что препятствуют прохождению мочи, их приходится удалять хирургическим путем, так как их невозможно заставить раствориться вновь. Ссылки по теме Болезни почек и мочевых путей